北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院作為中華人民共和國衛(wèi)生部唯一直屬高校（2002年9月后由教育部、衛(wèi)生部共建），與醫(yī)科院實行院校合一的管理體制，醫(yī)科院為北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院提供雄厚的師資和技術(shù)力量，北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院為國家培養(yǎng)高層次的醫(yī)學(xué)科學(xué)人才，相互依托，優(yōu)勢互補，教研相長，共同發(fā)展。

　　本科招生：我校本科招生有臨床醫(yī)學(xué)（八年制）專業(yè)和護理學(xué)專業(yè)。自2003年起，臨床醫(yī)學(xué)（八年制）專業(yè)的招生計劃納入清華大學(xué)總招生計劃，由兩校共同完成招生錄取工作。凡志愿報考協(xié)和“臨床醫(yī)學(xué)（八年制）”專業(yè)的考生，在填報志愿時應(yīng)報清華大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)，并可同時報清華大學(xué)其他理工類專業(yè)。通過強強合作，清華大學(xué)雄厚的基礎(chǔ)學(xué)科綜合優(yōu)勢和優(yōu)良的學(xué)術(shù)氛圍，與北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中強大的科學(xué)研究和臨床醫(yī)學(xué)實力，將得到充分的發(fā)揮。

　　研究生招生：協(xié)和醫(yī)大的研究生教育，強調(diào)科研創(chuàng)新能力與高層次專門人才培養(yǎng)并重。研究生院負責(zé)總體規(guī)劃、統(tǒng)籌管理全校的學(xué)位與研究生教育工作。各院系和科研單位是實施研究生教育的主體機構(gòu)。

　　繼續(xù)教育招生：協(xié)和醫(yī)大的繼續(xù)教育分成人教育、非學(xué)歷教育和培訓(xùn)兩類，是學(xué)校服務(wù)社會的重要途徑。管理、實施繼續(xù)教育的主體單位是繼續(xù)教育學(xué)院、網(wǎng)絡(luò)教育學(xué)院。非學(xué)歷教育管理辦公室主管全校的非學(xué)歷培訓(xùn)項目。