中國人民解放軍軍事工程學院于1952年開始籌建，1953年4月25日基建破土動工，9月1日舉行第一期開學典禮。

　　1955年初具規(guī)模，設有五個系和一個預科：一系空軍工程系、二系炮兵工程系、三系海軍工程系，四系裝甲兵工程系、五系工兵工程系和預科（1960年又增設防化系）。1970年國防科委命令“哈軍工”南遷與分建，“哈軍工”導彈工程系、電子工程系、計算機工程系以及院直機關內(nèi)遷長沙，成立“長沙工學院”（現(xiàn)為“國防科技大學”）。哈軍工“海軍工程系”及部分其他系部教師留在哈爾濱，組建“哈爾濱船舶工程學院”，1994年更名為“哈爾濱工程大學”。1978年，學校被國務院確定為全國重點大學；1982年成為首批具有博士、碩士學位授予權的單位；1996年進入首批“211工程”建設高校行列；2002年由教育部批準設立研究生院；2007年，由國防科工委、教育部、黑龍江省政府、海軍四方共建。學�，F(xiàn)隸屬于工業(yè)和信息化部。