林奈為分類學解決了兩個關鍵問題：第一是建立了雙名制，每一物種都給以一個學名，由兩個拉丁化名詞所組成，第一個代表屬名，第二個代表種名。第二是確立了階元系統(tǒng)，林奈把自然界分為植物、動物和礦物三界，在動植物界下，又設有綱、目、屬、種四個級別，從而確立了分類的階元系統(tǒng)。

　　每一物種都隸屬于一定的分類系統(tǒng)，占有一定的分類地位，可以按階元查對檢索。林奈在1753年印行的《植物種志》和1758年第10版《自然系統(tǒng)》中首次將階元系統(tǒng)應用于植物和動物。這兩部經(jīng)典著作，標志著近代分類學的誕生。