學(xué)校的前身是廣東省1954年創(chuàng)辦的海南黎族苗族自治州師范學(xué)校和1958年創(chuàng)辦的海南黎族苗族自治州師范專科學(xué)校。幾經(jīng)分合、調(diào)整、更名，于1993年由海南省通什師范�？茖W(xué)校和海南省通什教育學(xué)院合并組建為瓊州大學(xué)（�？疲�，2006年瓊州大學(xué)升格為本科院校，更名為瓊州學(xué)院，同年4月海南民族師范學(xué)校并入瓊州學(xué)院。2009年學(xué)校主校區(qū)由五指山市搬遷至三亞市。2015年9月，更名為海南熱帶海洋學(xué)院。2018年12月，海南省海洋與漁業(yè)科學(xué)院轉(zhuǎn)隸歸屬學(xué)校管理。