東南大學校區(qū)：

　　四牌樓校區(qū)：南京的中心玄武區(qū)四牌樓2號。校區(qū)東枕鐘山，北臨玄武湖，松檜薈翠，風景秀麗，占地641畝，建有各類建筑61.85萬平方米。該校區(qū)為研究生教育、本科生高年級教育、繼續(xù)教育（除醫(yī)學學科外）和科學技術研究基地。

　　丁家橋校區(qū)：鼓樓區(qū)丁家橋。占地176畝，已建各類建筑26萬平方米。該校區(qū)為醫(yī)學學科教育科研基地和東南大學附屬中大醫(yī)院所在地。

　　九龍湖校區(qū)：江寧經(jīng)濟技術開發(fā)區(qū)南部。2006年夏季起，東南大學主教學區(qū)遷至東南大學九龍湖校區(qū)，總面積3752.35畝。九龍湖校區(qū)建筑規(guī)劃以東南大學的歷史文脈為依據(jù)，采取公共核心教學組團與專業(yè)教學族群組團相結合的校園建筑形態(tài)九龍湖校區(qū)已建成教學區(qū)、科研實驗區(qū)、行政區(qū)、本科生生活區(qū)、研究生生活區(qū)、教師生活區(qū)、后勤保衛(wèi)區(qū)等，總建筑面積約59.9萬平方米。