學校下設(shè)第一臨床醫(yī)學院、第二臨床醫(yī)學院、第三臨床醫(yī)學院/康復醫(yī)學院、第四臨床醫(yī)學院、基礎(chǔ)醫(yī)學院/公共衛(wèi)生學院、口腔醫(yī)學院、藥學院、護理學院、醫(yī)學技術(shù)學院、生命科學學院、人文與管理學院以及馬克思主義學院、成人教育學院/繼續(xù)教育學院、國際教育學院，舉辦1所獨立學院（濱江學院）。擁有附屬第一醫(yī)院（浙江省中醫(yī)院）、附屬第二醫(yī)院（浙江省新華醫(yī)院）、附屬第三醫(yī)院（浙江省中山醫(yī)院）3所直屬附屬醫(yī)院和20所非直屬附屬醫(yī)院。