1996年，國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)組建地級(jí)宿遷市。建市之初，全市沒(méi)有一所高等院校。為推進(jìn)高教事業(yè)發(fā)展，1998年起，宿遷市依托中國(guó)礦業(yè)大學(xué)和原徐州師范大學(xué)（現(xiàn)江蘇師范大學(xué)）分別建立了中國(guó)礦業(yè)大學(xué)宿遷分校和徐州師范大學(xué)宿遷分校，2000年，省政府同意在礦大分�；�礎(chǔ)上籌建宿遷職業(yè)技術(shù)學(xué)院。

　　2002年6月，江蘇省人民政府印發(fā)《關(guān)于建立宿遷學(xué)院（宿遷職業(yè)技術(shù)學(xué)院）的通知》（蘇政發(fā)〔2002〕82號(hào)），決定“將宿遷職業(yè)技術(shù)學(xué)院（籌）和徐州師范大學(xué)宿遷分校合并組建宿遷學(xué)院（宿遷職業(yè)技術(shù)學(xué)院）�！�

　　合并組建的宿遷學(xué)院由院本部（宿遷職業(yè)技術(shù)學(xué)院）、師范部（宿遷師范、沭陽(yáng)師范）、電大部（宿遷廣播電視大學(xué)）組成。根據(jù)辦學(xué)需要，2003年-2009年，沭陽(yáng)師范、宿遷師范、宿遷職業(yè)技術(shù)學(xué)院、宿遷廣播電視大學(xué)先后從宿遷學(xué)院剝離出去獨(dú)立辦學(xué)。

　　考慮到宿遷市高等教育零基礎(chǔ)和經(jīng)濟(jì)基礎(chǔ)相對(duì)薄弱的實(shí)際，省市政府采取“省市共建、八校聯(lián)建、合作辦學(xué)、公辦民營(yíng)”的特殊體制與模式，組織南京師范大學(xué)、蘇州大學(xué)、揚(yáng)州大學(xué)、江蘇大學(xué)、南京工業(yè)大學(xué)、徐州師范大學(xué)（現(xiàn)江蘇師范大學(xué)）、南京財(cái)經(jīng)大學(xué)、南京工程學(xué)院等八所省屬高校和宿遷市合作舉辦宿遷學(xué)院。

　　2014年5月，教育部批準(zhǔn)宿遷學(xué)院為本科層次民辦普通高校，學(xué)校成為宿遷市第一所獨(dú)立設(shè)置的全日制本科院校。

　　2018年5月，宿遷學(xué)院通過(guò)省學(xué)位辦評(píng)審，成為學(xué)士學(xué)位授權(quán)單位。

　　2020年3月，江蘇省政府報(bào)請(qǐng)教育部批準(zhǔn)，宿遷學(xué)院轉(zhuǎn)制為省屬本科高校。