目前，學(xué)校有教職員工2700多人，在校生近1萬人；設(shè)有13個(gè)學(xué)院，兩個(gè)研究院。學(xué)校與美國、德國、澳大利亞、日本、馬來西亞、臺(tái)灣、香港等國家和地區(qū)的高等院校、科研醫(yī)療機(jī)構(gòu)、學(xué)術(shù)團(tuán)體建立了穩(wěn)定的合作關(guān)系。

　　學(xué)校的發(fā)展目標(biāo)是把學(xué)校建設(shè)成為一所以中醫(yī)藥為主體，多學(xué)科協(xié)調(diào)發(fā)展，服務(wù)海峽西岸經(jīng)濟(jì)區(qū)，具有鮮明辦學(xué)特色的教學(xué)研究型中醫(yī)藥大學(xué)。

　　學(xué)校有2個(gè)國家發(fā)展和改革委員會(huì)國家地方聯(lián)合工程研究中心，1個(gè)教育部省部共建重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，1個(gè)國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)康復(fù)研究中心，3個(gè)國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)研究室，8個(gè)國家（局級(jí)）三級(jí)科研實(shí)驗(yàn)室，2個(gè)省級(jí)“2011協(xié)同創(chuàng)新中心”，18個(gè)省級(jí)各類重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、基地及工程技術(shù)研究中心。

　　國家地方聯(lián)合工程研究中心：康復(fù)醫(yī)療技術(shù)國家地方聯(lián)合工程研究中心、閩臺(tái)中藥分子生物技術(shù)國家地方聯(lián)合工程研究中心。

　　教育部省部共建重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室：中醫(yī)骨傷及運(yùn)動(dòng)康復(fù)實(shí)驗(yàn)室。

　　國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)康復(fù)研究中心：中醫(yī)康復(fù)研究中心。

　　國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)研究室：中醫(yī)康復(fù)、中醫(yī)健康狀態(tài)辨識(shí)等。

　　國家（局級(jí)）三級(jí)科研實(shí)驗(yàn)室：病理生理學(xué)實(shí)驗(yàn)室、針灸生理實(shí)驗(yàn)室、骨重建生物力學(xué)實(shí)驗(yàn)室、中醫(yī)康復(fù)技術(shù)實(shí)驗(yàn)室、分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室、中藥藥理（細(xì)胞結(jié)構(gòu)與功能）實(shí)驗(yàn)室、中藥、細(xì)胞生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室。

　　省級(jí)“2011協(xié)同創(chuàng)新中心”：康復(fù)技術(shù)協(xié)同創(chuàng)新中心、中醫(yī)健康管理協(xié)同創(chuàng)新中心。