商丘職業(yè)技術(shù)學(xué)院現(xiàn)設(shè)有軟件學(xué)院、經(jīng)貿(mào)系、機(jī)電工程系、計(jì)算機(jī)系、園林食品加工系、生物工程系、語言文學(xué)系、體育與藝術(shù)系、動(dòng)物工程系、汽車與建筑工程系、五年制大專部等教學(xué)系（院、部），開設(shè)有軟件技術(shù)、會(huì)計(jì)電算化、畜牧獸醫(yī)、園林技術(shù)、電子信息工程技術(shù)、機(jī)械制造與自動(dòng)化、汽車檢測與維修技術(shù)、旅游管理等專業(yè)。