cDNA不是雙鏈，而是經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄后與RNA互補(bǔ)的DNA鏈。
cDNA是指具有與某RNA鏈呈互補(bǔ)堿基序列的DNA。與RNA鏈互補(bǔ)的單鏈DNA，以其RNA為模板，在適當(dāng)引物的存在下，由依賴RNA的DNA聚合酶作用而合成。
并且在合成單鏈cDNA后，再用堿處理除去與其對應(yīng)的RNA以后，以單鏈cDNA為模板，由依賴DNA的DNA聚合酶或依賴RNA的DNA聚合酶作用合成雙鏈cDNA。
在這種情況下，mRNA的cDNA，與原來的基因組DNA相同而且無內(nèi)含子；相反地，對應(yīng)于在原來基因中沒有的而在mRNA存在的3'末端的poly A序列等的核苷序列上，與外顯子序列、先導(dǎo)序列以及后續(xù)序列等一起反映出mRNA結(jié)構(gòu)。