1926年，經濟學系建立。1952年，中國高等學校院系調整，經濟學系并入其他高校。1979年，經濟管理工程系建立；開始舉辦管理工程專業(yè)碩士研究生項目。1980年，開始舉辦的本科項目。1984年，經濟管理學院正式成立，朱镕基出任第一任院長。2004年，企業(yè)管理系分為人力資源系、市場營銷系和企業(yè)戰(zhàn)略與政策系。

　　據2020年2月學院官網顯示，清華大學經濟管理學院設有7個系、3個本科專業(yè)；有3個博士后科研流動站，設有4個學術學位一級學科博士點、8個學術學位二級學科博士點、2個學術學位一級學科碩士點、3個學術學位二級學科碩士點、專業(yè)碩士領域3個；共有162位全職教師，158位擁有博士學位，51%獲海外博士學位。